Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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FOXO1Q12778 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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FOXO1Q12778 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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FOXO1Q12778 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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FOXO1Q12778 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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