Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RASGEF1BQ0VAM2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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