Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms