Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCBP1Q09161 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCBP1Q09161 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCBP1Q09161 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCBP1Q09161 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCBP1Q09161 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCBP1Q09161 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCBP1Q09161 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NCBP1Q09161 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCBP1Q09161 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCBP1Q09161 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCBP1Q09161 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCBP1Q09161 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
NCBP1Q09161 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCBP1Q09161 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCBP1Q09161 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCBP1Q09161 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCBP1Q09161 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCBP1Q09161 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCBP1Q09161 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCBP1Q09161 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms