Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms