Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD47Q08722 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD47Q08722 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms