Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms