Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms