Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms