Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms