Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC2Q02487 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms