Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms