Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC42EP1Q00587 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms