Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms