Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1AP62820 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms