Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms