Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CLDN15P56746 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CLDN15P56746 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CLDN15P56746 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CLDN15P56746 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CLDN15P56746 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CLDN15P56746 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CLDN15P56746 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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