Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms