Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD4P55036 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD4P55036 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD4P55036 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD4P55036 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD4P55036 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD4P55036 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD4P55036 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD4P55036 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD4P55036 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD4P55036 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD4P55036 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMD4P55036 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms