Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KPNA1P52294 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms