Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNA2P51530 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNA2P51530 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNA2P51530 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNA2P51530 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNA2P51530 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DNA2P51530 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNA2P51530 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DNA2P51530 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNA2P51530 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DNA2P51530 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DNA2P51530 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNA2P51530 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DNA2P51530 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNA2P51530 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNA2P51530 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNA2P51530 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNA2P51530 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNA2P51530 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNA2P51530 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNA2P51530 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNA2P51530 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNA2P51530 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNA2P51530 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNA2P51530 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNA2P51530 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNA2P51530 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNA2P51530 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNA2P51530 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNA2P51530 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNA2P51530 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNA2P51530 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNA2P51530 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNA2P51530 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNA2P51530 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNA2P51530 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNA2P51530 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNA2P51530 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNA2P51530 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNA2P51530 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNA2P51530 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNA2P51530 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNA2P51530 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNA2P51530 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNA2P51530 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNA2P51530 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNA2P51530 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNA2P51530 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNA2P51530 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNA2P51530 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNA2P51530 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNA2P51530 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNA2P51530 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNA2P51530 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNA2P51530 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNA2P51530 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNA2P51530 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNA2P51530 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNA2P51530 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNA2P51530 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNA2P51530 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNA2P51530 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNA2P51530 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNA2P51530 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNA2P51530 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNA2P51530 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNA2P51530 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNA2P51530 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms