Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCLMP48507 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCLMP48507 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCLMP48507 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCLMP48507 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCLMP48507 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCLMP48507 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCLMP48507 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCLMP48507 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GCLMP48507 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCLMP48507 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCLMP48507 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCLMP48507 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCLMP48507 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCLMP48507 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCLMP48507 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCLMP48507 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCLMP48507 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCLMP48507 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCLMP48507 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCLMP48507 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCLMP48507 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCLMP48507 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCLMP48507 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCLMP48507 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GCLMP48507 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GCLMP48507 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCLMP48507 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCLMP48507 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCLMP48507 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCLMP48507 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCLMP48507 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCLMP48507 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCLMP48507 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GCLMP48507 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms