Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms