Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms