Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP3P42574 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP3P42574 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP3P42574 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP3P42574 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP3P42574 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP3P42574 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP3P42574 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP3P42574 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP3P42574 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP3P42574 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP3P42574 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP3P42574 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP3P42574 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP3P42574 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP3P42574 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP3P42574 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP3P42574 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP3P42574 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP3P42574 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms