Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms