Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms