Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BMI1P35226 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BMI1P35226 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BMI1P35226 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BMI1P35226 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BMI1P35226 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BMI1P35226 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BMI1P35226 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BMI1P35226 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BMI1P35226 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms