Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC8A1P32418 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms