Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms