Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX2P28328 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms