Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms