Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB1P16220 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB1P16220 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB1P16220 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB1P16220 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB1P16220 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB1P16220 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB1P16220 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB1P16220 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB1P16220 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB1P16220 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB1P16220 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB1P16220 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB1P16220 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB1P16220 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB1P16220 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB1P16220 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB1P16220 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB1P16220 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB1P16220 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB1P16220 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB1P16220 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB1P16220 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB1P16220 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB1P16220 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB1P16220 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB1P16220 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB1P16220 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB1P16220 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREB1P16220 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB1P16220 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB1P16220 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB1P16220 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB1P16220 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB1P16220 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB1P16220 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB1P16220 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB1P16220 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB1P16220 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB1P16220 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB1P16220 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB1P16220 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB1P16220 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB1P16220 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB1P16220 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB1P16220 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB1P16220 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB1P16220 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB1P16220 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB1P16220 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB1P16220 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB1P16220 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB1P16220 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB1P16220 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB1P16220 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB1P16220 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB1P16220 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB1P16220 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREB1P16220 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CREB1P16220 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CREB1P16220 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CREB1P16220 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CREB1P16220 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CREB1P16220 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CREB1P16220 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CREB1P16220 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CREB1P16220 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms