Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms