Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL4AP11441 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms