Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CT47B1P0C2W7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CT47B1P0C2W7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms