Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HSP90AB1P08238 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms