Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRB1P04280 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRB1P04280 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRB1P04280 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRB1P04280 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRB1P04280 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRB1P04280 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRB1P04280 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRB1P04280 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRB1P04280 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRB1P04280 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRB1P04280 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRB1P04280 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRB1P04280 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRB1P04280 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRB1P04280 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRB1P04280 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRB1P04280 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRB1P04280 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRB1P04280 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRB1P04280 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRB1P04280 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRB1P04280 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRB1P04280 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRB1P04280 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRB1P04280 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRB1P04280 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRB1P04280 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRB1P04280 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRB1P04280 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRB1P04280 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRB1P04280 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRB1P04280 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRB1P04280 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRB1P04280 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRB1P04280 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRB1P04280 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRB1P04280 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRB1P04280 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRB1P04280 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRB1P04280 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRB1P04280 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRB1P04280 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRB1P04280 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRB1P04280 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRB1P04280 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRB1P04280 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRB1P04280 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRB1P04280 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRB1P04280 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRB1P04280 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRB1P04280 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRB1P04280 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRB1P04280 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRB1P04280 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRB1P04280 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRB1P04280 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRB1P04280 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRB1P04280 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRB1P04280 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRB1P04280 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRB1P04280 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms