Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

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Length 923 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
RAPGEF3O95398 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
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