Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT7O43581 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT7O43581 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT7O43581 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT7O43581 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT7O43581 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT7O43581 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT7O43581 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT7O43581 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT7O43581 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT7O43581 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT7O43581 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT7O43581 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT7O43581 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT7O43581 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT7O43581 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT7O43581 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT7O43581 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT7O43581 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT7O43581 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms