Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNPHO15079 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNPHO15079 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNPHO15079 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNPHO15079 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNPHO15079 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNPHO15079 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNPHO15079 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNPHO15079 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNPHO15079 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNPHO15079 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNPHO15079 IL4-204ENST00000622422 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNPHO15079 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNPHO15079 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNPHO15079 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNPHO15079 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNPHO15079 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNPHO15079 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 AL390039.1-201ENST00000399148 611 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 AC069503.1-202ENST00000616576 642 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNPHO15079 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNPHO15079 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms