Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3AO14802 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms