Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.05■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms