Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD3A6NKT7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms