Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD3L3A6NE82 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms