Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF22A3QJZ6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms