Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms