Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms