Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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