Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS3Q9UNS2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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